1、過濾除菌法是用物理阻留的方法將液體或空氣的細菌除去，以達到無菌目的。所用的器具是含有微小孔徑的濾菌器（filter）。

2、主要用於血清、毒素、抗生素等不耐熱生物製品及空氣的除菌。常用的濾菌器有薄膜濾菌器（0.45μm和0.22μm孔徑）、陶瓷濾菌器、石棉濾菌器（即Seitz濾菌器）、燒結玻璃濾菌器等。